Publikace detail

Simulation of Emission Spectra for LH4 Ring: Intermolecular Coupling Fluctuation Effect

Autoři: Heřman Pavel | Zapletal David

Rok: 2014

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: International Journal of Mathematics and Computers in Simulation

Název nakladatele: North Atlantic University Union (NAUN)

Místo vydání: Madison

Strana od-do: 73-81

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Simulace emisních spekter pro prstenec LH4: Efekt fluktuace mezimolekulárních vazeb	Fotosyntéza začíná absorpcí slunečního fotonu v jednom ze světlosběrných (LH) pigment-proteinových komplexů a přenosem excitační energie do reakčního centra, kde je iniciována separace náboje. Znalost mikroskopické struktury některých fotosyntetických systémů vyvolala v posledních dvaceti letech intenzivní výzkum v mnoha teoretických i experimentálních laboratořích. Geometrická struktura LH komplexů je známa do detailu např. pro komplexy LH2 a LH4 z purpurových bakterií. V článku jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro prstencový molekulární systém. Takovým systémem může být modelována periferní anténní jednotka LH4 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spektrální odezvy systému s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. V simulacích je zahrnut dynamický nepořádek (vazba s lázní) v Markovovské aproximaci zároveň s nekorelovaným statickým nepořádkem v transferintegrálech. Jsou porovnávána vypočtená spektra proprstenec LH4 v rámci modelu plného Hamiltoniánu a našimi předchozími výsledky získanými v rámci aproximace nejbližších sousedů. Všechny výpočty byly provedeny pomocí softwarového balíku Mathematica.	LH4; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; Mathematica
eng	Simulation of Emission Spectra for LH4 Ring: Intermolecular Coupling Fluctuation Effect	Photosynthesis starts with the absorption of a solar photon by one of the light-harvesting (LH) pigment-protein complexes and transferring the excitation energy to the reaction center where a charge separation is initiated. Knowledge of the microscopic structure of some photosynthetic systems and their function invokes during last twenty years long and intensive investigation of many theoretical and experimental laboratories. The geometric structure of LH complexes is known in great detail, e.g. for the LH2 and LH4 complexes of purple bacteria. Absorption and steady state fluorescence spectra for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH4 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in transfer integrals are taking into account in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra for LH4 ring obtained within the full Hamiltonian model with our previous results within nearest neighbour approximation model for uncorrelated static disorder in transfer integrals. All calculations were done in software package Mathematica.	LH4; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; Mathematica

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Ústavy

Pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte