Publikace detail

Computer Simulation of Emission and Absorption Spectra for LH2 Ring

Autoři: Heřman Pavel | Zapletal David

Rok: 2015

Druh publikace: článek ve sborníku

Název zdroje: Computational Problems in Science and Engineering

Název nakladatele: Springer

Místo vydání: Heidelberg

Strana od-do: 221-234

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Počítačová simulace emisních a absorpčních spekter pro LH2 prstenec	Je prezentována počítačová simulace absorpčních a stacionárních fluorescenčních spekter pro molekulární systém. Zaměřujeme se na prstenec B850 z periferní antenní jednotky LH2 z fotosystému purpurových bakterií. V simulacích je zahrnut nekorelovaný statický nepořádek v radiálních pozicích molekul v prstenci. Předpokládáme též vliv dynamického nepořádku, interakci s fononovou lázní v markovovském přiblížení. Spektrální odezvy jsou počítány pomocí Mukamelovy metody kumulantů. Pro výpočet "single ring" spekter v rámci modelu plného hamiltoniánu byla vytvořena procedura ve Fortranu. Nové výsledky jsou porovnány s našimi předchozími výsledky (v rámci aproximace nejbližších sousedů), které byly získány pomocí softwarového balíku Mathematica.	prstenec B850 z LH2; statický nepořádek v radiálních pozicích molekul; dynamický nepořádek; fluorescenční spektrum; absorpční spektrum
eng	Computer Simulation of Emission and Absorption Spectra for LH2 Ring	Computer simulation of absorption and steady state fluorescence spektra for molecular system is presented. We focus on the B850 ring from peripheral cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacteria. Uncorrelated static disorder in radial positions of molecules on the ring is taking into account in our simulations. We consider also influence of dynamic disorder, interaction with phonon bath, in Markovian approximation. Spectral responses are calculated by the cumulant-expansion method of Mukamel et al. Procedure in Fortran was created for calculation of single ring spectra within full Hamiltonian model. These new results are compared with our previous ones (within the nearest neighbour approximation model) that were obtained by software package Mathematica.	B850 ring from LH2; static disorder in radial positions of molecules; dynamic disorder; fluorescence spectrum; absorption spectrum

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Ústavy

Pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte