Publikace detail

Computer Simulation of Absorption and Steady State Fluorescence Spectra of LH4 - Full Hamiltonian Model

Autoři: Horák Milan | Heřman Pavel | Zapletal David

Rok: 2013

Druh publikace: článek ve sborníku

Název zdroje: European Computing Conference (ECC 2013) : proceedings

Název nakladatele: WSEAS Press

Místo vydání: Atény

Strana od-do: 391-396

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Počítačová simulace absorpčních a stacionárních fluorescenčních spekter komplexu LH4 - model plného hamiltoniánu	Jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra a lokalizace excitonových stavů pro prstencový molekulární systém. Pomocí takového systému je možné modelovat periferní anténní komplex LH4 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spekter pro systém s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. Do simulací je zahrnut vliv dynamického nepořádku, interakce s fononovou lázní v markovovském přiblížení, současně s nekorelovaným statickáým nepořádkem v lokálních excitačních energiích. Výsledná absorbční a fluorescenční spektra (model plného hamiltoniánu) jsou porovnána s našimi předchozími výsledky získanými v rámci aproximace nejbližších sousedů. Všechny výpočty byly provedeny pomocí softwarového balíku Mathematica.	LH4; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; lokalizace; Mathematica
eng	Computer Simulation of Absorption and Steady State Fluorescence Spectra of LH4 - Full Hamiltonian Model	Absorption and steady state fluorescence spectra and localization of exciton states for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH4 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in local excitation energies are taking into account in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra for LH4 ring obtained within the full Hamiltonian model with our previous results calculated within the nearest neighbour approximation model. All calculations were done in software package Mathematica.	LH4; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; localization; Mathematica

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Ústavy

Pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte