Publication detail

Light harvesting complex LH2 - simulation of spectral profiles

Authors: Heřman Pavel | Zapletal David

Year: 2019

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: International Journal of Biology and Biomedical Engineering

Page from-to: 10-19

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Světlosběrný komplex LH2 - simulace spektrálních profilů	Jsou simulována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro relativně jednoduchý prstencový molekulární systém. Tem může představovat model periferníhosvětlosběrného komplexu LH2 z purpurové bakterie Rhodopseudomonas acidophila. V modelu jsou zahrnuty oba prstence (prstenec B850 i prstenec B800). Spektra jsou počítána za použití modelu plného hamiltoniánu a porovnávána pro dva typy fluktuací, a to Gausovské fluktuace lokálních excitačních energií a Gausovské fluktuace poloh jednotlivých bakteriochlorofylů. Jsou zahrnuty též rychlé fluktuace, interakce s fononovou lázní, při nízké a pokojové teplotě. Výsledná spektra ukazují silnou závislost na teplotě. Při nízké teplotě je viditelné rozštěpení obou spekter. Za zmínku stojí také rozdíly způsobené typem statického nepořádku. Je vyšetřována též lokalizace excitonových stavů přispívajících ke stacionárnímu fluorescenčnímu spektru.	LH2; prstenec B800; prstenec B850; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; lokalizace
eng	Light harvesting complex LH2 - simulation of spectral profiles	Absorption and steady state fluorescence spectra are simulated for relatively simple circular molecular system. It can be treated as a model of peripheral light harvesting complex LH2 from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila. Both rings (B850 ring and B800 one) are included in our model. The spectra are calculated within full Hamiltonian model and compared for two types of slow fluctuations. Gaussian fluctuations in local excitations energies and Gaussian fluctuations in positions of bacteriochlorophylls are considered. Fast fluctuations, interaction with phonon bath, is also taking into account for low and room temperature. The resulting spectra show strong dependence on temperature. Splitting of both spectra are visible at low temperature. The differences caused by static disorder type are also remarkable. Localization of exciton states contributing to the steady state fluorescence spectra is investigated by thermally averaged participation ratio.	LH2; B800 ring; B850 ring; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; localization

Search

Login for students

Login for employees

Publication detail

Map

Services

Popular Links