Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Simulation of Emission and Absorption Spectra of Full LH2 Complex (B850 Ring and B800 Ring) - Full Hamiltonian Model
Authors: Horák Milan | Heřman Pavel | Zapletal David
Year: 2015
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Proceedings of the 6th European Conference of Computer Science (ECCS '15)
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 117-126
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Simulace emisních a absorpčních spekter plného komplexu LH2 (prstenec B850 a prstenec B800) - model pného Hamiltoniánu Jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro prstencové molekulární systémy. Pomocí takového systému může být modelována periferní cyklická anténní jednotka LH2 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spektrální odezvy systému s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. V simulacích je zahrnut vliv dynamického nepořádku, interakce s lázní v Markovovské aproximaci, zároveˇn s nekorelovaným statickým nepořádkem v lokálních excitačních energiích. Porovnáváme vypočtená absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro plný komplex LH2 (prstenec B850 a prstenec B800) s našimi předchozími výsledky získanými pouze pro prstenec B850. LH2; prstenec B800; prstenec B850; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek
eng Simulation of Emission and Absorption Spectra of Full LH2 Complex (B850 Ring and B800 Ring) - Full Hamiltonian Model Absorption and steady state fluorescence spectra for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in local excitation energies are taking into account in our simulations. Full LH2 complex (B850 ring and B800 ring) is considered in our simulations. Results calculated within full Hamiltonian model are presented and compared with our previous ones calculated witin the nearest neighbour approximation model. LH2; B800 ring; B850 ring; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder