Login for students

Login for employees

Publication detail

Computer Simulation of Emission and Absorption Spectra for LH2 Ring
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David
Year: 2015
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Computational Problems in Science and Engineering
Publisher name: Springer
Place: Heidelberg
Page from-to: 221-234
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Počítačová simulace emisních a absorpčních spekter pro LH2 prstenec Je prezentována počítačová simulace absorpčních a stacionárních fluorescenčních spekter pro molekulární systém. Zaměřujeme se na prstenec B850 z periferní antenní jednotky LH2 z fotosystému purpurových bakterií. V simulacích je zahrnut nekorelovaný statický nepořádek v radiálních pozicích molekul v prstenci. Předpokládáme též vliv dynamického nepořádku, interakci s fononovou lázní v markovovském přiblížení. Spektrální odezvy jsou počítány pomocí Mukamelovy metody kumulantů. Pro výpočet "single ring" spekter v rámci modelu plného hamiltoniánu byla vytvořena procedura ve Fortranu. Nové výsledky jsou porovnány s našimi předchozími výsledky (v rámci aproximace nejbližších sousedů), které byly získány pomocí softwarového balíku Mathematica. prstenec B850 z LH2; statický nepořádek v radiálních pozicích molekul; dynamický nepořádek; fluorescenční spektrum; absorpční spektrum
eng Computer Simulation of Emission and Absorption Spectra for LH2 Ring Computer simulation of absorption and steady state fluorescence spektra for molecular system is presented. We focus on the B850 ring from peripheral cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacteria. Uncorrelated static disorder in radial positions of molecules on the ring is taking into account in our simulations. We consider also influence of dynamic disorder, interaction with phonon bath, in Markovian approximation. Spectral responses are calculated by the cumulant-expansion method of Mukamel et al. Procedure in Fortran was created for calculation of single ring spectra within full Hamiltonian model. These new results are compared with our previous ones (within the nearest neighbour approximation model) that were obtained by software package Mathematica. B850 ring from LH2; static disorder in radial positions of molecules; dynamic disorder; fluorescence spectrum; absorption spectrum

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives