Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Simulations of Absorption and Emission Spectra for LH4 Ring - Full Hamiltonian Model
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David | Šlégr Jan
Year: 2014
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Recent Advances in Applied Mathematics, Modelling and Simulation
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 286-294
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Simulace absorpčních a emisních spekter pro prstenec LH4 - model plného hamiltoniánu Jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro prstencové molekulární systémy. Pomocí takového systému může být modelována periferní anténní jednotka LH4 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spekter systému s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. V simulacích je zahrnut vliv dynamického nepořádku, interakce s fononovou lázní, v Markovovské aproximaci současně s nekorelovaným statickým nepořádkem v radiálních pozicích molekul. Porovnáváme vypočtená spektra pro prstenec LH4 získaná v rámci modelu plného hamiltoniánu s našimi předchozími výsledky získanými v rámci aproximace interakcí mezi nejbližšími sousedy a též s jinými typy nekorelovaného statického nepořádku. LH4; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; lokalizace
eng Simulations of Absorption and Emission Spectra for LH4 Ring - Full Hamiltonian Model Absorption and steady state fluorescence spectra of exciton states for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH4 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in radial positions of molecules are taking into account in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra for LH4 ring obtained within the full Hamiltonian model with our previous results within nearest neighbour approximation model and also with different types of uncorrelated static disorder. LH4; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; localization