Login for students

Login for employees

Publication detail

Simulation of Emission Spectra for LH4 Ring: Intermolecular Coupling Fluctuation Effect
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David
Year: 2014
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: International Journal of Mathematics and Computers in Simulation
Publisher name: North Atlantic University Union (NAUN)
Place: Madison
Page from-to: 73-81
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Simulace emisních spekter pro prstenec LH4: Efekt fluktuace mezimolekulárních vazeb Fotosyntéza začíná absorpcí slunečního fotonu v jednom ze světlosběrných (LH) pigment-proteinových komplexů a přenosem excitační energie do reakčního centra, kde je iniciována separace náboje. Znalost mikroskopické struktury některých fotosyntetických systémů vyvolala v posledních dvaceti letech intenzivní výzkum v mnoha teoretických i experimentálních laboratořích. Geometrická struktura LH komplexů je známa do detailu např. pro komplexy LH2 a LH4 z purpurových bakterií. V článku jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro prstencový molekulární systém. Takovým systémem může být modelována periferní anténní jednotka LH4 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spektrální odezvy systému s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. V simulacích je zahrnut dynamický nepořádek (vazba s lázní) v Markovovské aproximaci zároveň s nekorelovaným statickým nepořádkem v transferintegrálech. Jsou porovnávána vypočtená spektra proprstenec LH4 v rámci modelu plného Hamiltoniánu a našimi předchozími výsledky získanými v rámci aproximace nejbližších sousedů. Všechny výpočty byly provedeny pomocí softwarového balíku Mathematica. LH4; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; Mathematica
eng Simulation of Emission Spectra for LH4 Ring: Intermolecular Coupling Fluctuation Effect Photosynthesis starts with the absorption of a solar photon by one of the light-harvesting (LH) pigment-protein complexes and transferring the excitation energy to the reaction center where a charge separation is initiated. Knowledge of the microscopic structure of some photosynthetic systems and their function invokes during last twenty years long and intensive investigation of many theoretical and experimental laboratories. The geometric structure of LH complexes is known in great detail, e.g. for the LH2 and LH4 complexes of purple bacteria. Absorption and steady state fluorescence spectra for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH4 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in transfer integrals are taking into account in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra for LH4 ring obtained within the full Hamiltonian model with our previous results within nearest neighbour approximation model for uncorrelated static disorder in transfer integrals. All calculations were done in software package Mathematica. LH4; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; Mathematica

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives