Login for students

Login for employees

Publication detail

Computer Simulation of Absorption and Steady State Fluorescence Spectra of LH4 - Full Hamiltonian Model
Authors: Horák Milan | Heřman Pavel | Zapletal David
Year: 2013
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: European Computing Conference (ECC 2013) : proceedings
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 391-396
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Počítačová simulace absorpčních a stacionárních fluorescenčních spekter komplexu LH4 - model plného hamiltoniánu Jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra a lokalizace excitonových stavů pro prstencový molekulární systém. Pomocí takového systému je možné modelovat periferní anténní komplex LH4 z bakteriálního fotosystému purpurových bakterií. Pro výpočet spekter pro systém s exciton-fononovou vazbou je použita Mukamelova metoda kumulantů. Do simulací je zahrnut vliv dynamického nepořádku, interakce s fononovou lázní v markovovském přiblížení, současně s nekorelovaným statickáým nepořádkem v lokálních excitačních energiích. Výsledná absorbční a fluorescenční spektra (model plného hamiltoniánu) jsou porovnána s našimi předchozími výsledky získanými v rámci aproximace nejbližších sousedů. Všechny výpočty byly provedeny pomocí softwarového balíku Mathematica. LH4; absorpční a fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy; lokalizace; Mathematica
eng Computer Simulation of Absorption and Steady State Fluorescence Spectra of LH4 - Full Hamiltonian Model Absorption and steady state fluorescence spectra and localization of exciton states for ring molecular systems are presented. The peripheral cyclic antenna unit LH4 of the bacterial photosystem from purple bacteria can be modeled by such system. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with uncorrelated static disorder in local excitation energies are taking into account in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra for LH4 ring obtained within the full Hamiltonian model with our previous results calculated within the nearest neighbour approximation model. All calculations were done in software package Mathematica. LH4; absorption and fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states; localization; Mathematica

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives