Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Emission spectra of LH2 complex: full Hamiltonian model
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David | Horák Milan
Year: 2013
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: European Physical Journal B
Publisher name: Springer
Place: Heidelberg
Page from-to: 1-6
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Emisní spektra komplexu LH2: model plného hamiltoniánu V tomto článku studujeme absorpční a stacionární fluorescenční spektra prstencového molekulárního systému, který může modelovat prstenec B850 periferního světlosběrného komplexu LH2 z purpurové bakterie Rhodopseudomonas acidophila (Rhodoblastus acidophilus). LH2 je vysoce symetrický prstenec s devíti pigment-proteinovými podjednotkami, každá obsahuje dvě polypeptidové šroubovice a tři bakteriochlorofyly (BChl). V našich simulacích je použit nekorelovaný diagonální statický nepořádek s Gaussovským rozdělením (fluktuace lokálních excitačních energií) současně s diagonálním dynamickým nepořádkem (interakcí s lázní) v Markovovské aproximaci. Porovnáváme vypočtená absorpční a stacionární fluorescenční spektra získaná v rámci modelu plného hamiltoniánu s našimi předchozími výsledky pořítanými v rámci aproximace nejbližších sousedůl a také s experimentálními daty. Emisní spectra; LH2 komplex; model plného hamiltoniánu
eng Emission spectra of LH2 complex: full Hamiltonian model In the present contribution we study the absorption and steady-state fluorescence spectra for ring molecular system, which can model B850 ring of peripheral light-harvesting complex LH2 from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila (Rhodoblastus acidophilus). LH2 is a highly symmetric ring of nine pigment-protein subunits, each containing two transmembrane polypeptide helixes and three bacteriochlorophylls (BChl). The uncorrelated diagonal static disorder with Gaussian distribution (fluctuations of local excitation energies) simultaneously with the diagonal dynamic disorder (interaction with a bath) in Markovian approximation is used in our simulations. We compare calculated absorption and steady state fluorescence spectra obtained within the full Hamiltonian model of the B850 ring with our previous results calculated within the nearest neighbour approximation model and also with experimental data. Emission spectra; LH2 complex; full Hamiltonian model