Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Computer Simulation of Spectra for Molecular Ring: LH4 - Different Types of Static Disorder
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David
Year: 2012
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Recent Advances in Information Science
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 79-84
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Počítačová simulace spekter pro molekulární prstenec: LH4 - různé typy statického nepořádku Jsou prezentována absorpční a stacionární fluorescenční spektra pro prstencové molekulární systémy. Pomocí takovýchto systémů lze modelovat bakteriální fotosystémy LH2 a LH4 z purpurových bakterií Rhodopseudomonas acidophila a Rhodopseudomonas palustris. K výpočtu spekter pri započítání exciton - fononové vazby je použita Mukamelova metoda kumulantů. Dynamický nepořádek, interakce s lázní, je zahrnuta v Markovovské aproximaci současně s dvěma různými typy nekorelovaného statického nepořádku (fluktuace lokálních excitačních energií a fluktuace transferintegrálů). Všechny výpočty jsou provedeny pomocí softwarového balíku Mathematica. LH2; LH4; absorpční spektrum; fluorescenční spektrum; statický nepořádek; dynamický nepořádek; excitonové stavy; Mathematica
eng Computer Simulation of Spectra for Molecular Ring: LH4 - Different Types of Static Disorder Absorption and steady state fluorescence spectra for ring molecular systems are presented. The cyclic antenna units LH2 and LH4 of the bacterial photosystem from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila and Rhodopseudomonas palustris can be modeled by such systems. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Dynamic disorder, interaction with a bath, in Markovian approximation simultaneously with two different types of uncorrelated static disorder (the local excitation energy fluctuations and the transfer integral fluctuations) are taking into account in our simulations. All calculations were done in software package Mathematica. LH2; LH4; absorption spectrum; fluorescence spectrum; static disorder; dynamic disorder; exciton states; Mathematica