Login for students

Login for employees

Publication detail

Simulation of molecular ring emission spectra: localization of exciton states and dynamics
Authors: Zapletal David | Heřman Pavel
Year: 2012
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: International Journal of Mathematics and Computers in Simulation
Publisher name: North Atlantic University Union (NAUN)
Place: Madison
Page from-to: 144-152
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Simulace emisních spekter molekulárního prstence: lokalizace excitonových stavů a dynamik V článku je prezentována počítačová simulace stacionárních fluorescenčních spekter molekulárního prstence. Pomocí takového systému může být modelována anténní jednotka LH2 z bakteriálního fotosystému purpurové bakterie Rhodopseudomonas acidophila. V našich simulacích jsou použity tři různé modely nekorelovaného statického nepořádku: Gaussovský nepořádek v lokálních excitačních energiích, Gaussovský nepořádek v transferintegrálech, Gaussovský nepořádek v radiálních pozicích molekul v prstenci. Dynamický nepořádek, interakce s lázní, je také zahrnuta v Markovovské aproximaci. Pro výpočet spekter pro systém s vazbou na fonony je použita Mukamelova metoda kumulantů. Poloha maxima "single ring" spektra a lokalizace excitonových stavů závisí na realizaci statického nepořádku a je také ovlivněna dynamickým nepořádkem. Diskutujeme též různé typy excitonové dynamiky, které jsou spojeny s výše zmíněnými efekty a porovnáváme výsledky získané se započtením vlivu dynamického nepořádku s výsledky bez dynamického nepořádku. Dynamický nepořádek; excitonové stavy; fluorescenční spektrum; LH2; Mathematica; statický nepořádek
eng Simulation of molecular ring emission spectra: localization of exciton states and dynamics Computer simulation of steady state fluorescence spectra of the ring molecular system is presented in this paper. The cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila can be modeled by such system. Three different models of uncorrelated static disorder are taking into account in our simulations: Gaussian disorder in local excitation energies, Gaussian disorder in nearest neighbour transfer integrals and Gaussian disorder in radial positions of molecules in the ring. Dynamic disorder, interaction with a bath, is also included in Markovian approximation. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. The peak position of single ring spectra and localization of exciton states depend on realization of static disorder and is also influenced by dynamic disorder. We discuss different types of exciton dynamics too, that are coupled to above mentioned effects and compare the results in that the dynamic disorder is taken into account with the results without dynamic disorder. Dynamic disorder; exciton states; fluorescence spectrum; LH2; Mathematica; static disorder

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives