Login for students

Login for employees

Publication detail

Computer Simulation of Steady State Emission and Absorption Spectra for Molecular Ring
Authors: Heřman Pavel | Zapletal David | Horák Milan
Year: 2011
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Proceedings of the 5th International Conference on Advanced Engineering Computing and Applications in Sciences
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 1-6
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Počítačová simulace stacionárních emisních a absorpčních spekter pro molekulární prstenec Softwarový balík Mathematica je použit pro simulaci absorpčních a stacionárních fluorescenčních spekter pro prstencový molekulární systém, který může modelovat cyklickou anténní jednotku LH2 z bakteriálního systému purpurové bakterie Rhodopseudomonas acidophila. V simulacích jsou použity tři různé modely nekorelovaného statického nepořádku: Gausovský nepořádek v lokálních excitačních energiích, Gausovský nepořádek v transferintegrálech a Gausovský nepořádek v radiálních pozicích molekul v prstenci. Je yahnut též dynamický nepořádek, interakce s fononovou lázní v markovovské aproximaci. Pro výpočet spekter je použita Mukamelova metoda kumulantů. Vypočtená spektra jsou porovnána s experimentálními výsledky. Ze simulací jsou odhadnuty hodnoty interakční energie mezi pigmenty a excitační energie ze základního stavu. prstenec LH2; exciton; fluorescenční spektrum; statický nepořádek; dynamický nepořádek; Mathematica
eng Computer Simulation of Steady State Emission and Absorption Spectra for Molecular Ring Software package Mathematica is used for computer simulation of absorption spectra and steady state fluorescence spectra of ring molecular system, which can model cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila. Three different models of uncorrelated static disorder are included in our simulations: Gaussian disorder in local excitation energies, Gaussian disorder in nearest neighbour transfer integrals and Gaussian disorder in radial positions of molecules in the ring. Dynamic disorder, interaction with a bath, is also included in Markovian approximation. The cumulant-expansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. Calculated fluorescence spectra are compared with measured one. Values of the interpigment interaction energy and unperturbed transition energy from the ground state for above mentioned static disorder types are given. LH2 ring; exciton; fluorescence spectrum; static disorder; dynamic disorder; Mathematica

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives