Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Computer simulation of fluorescence spectra for molecular ring: Exciton dynamics
Authors: Zapletal David | Heřman Pavel
Year: 2011
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Proceedings of the 13th WSEAS International Conference on Mathematical and Computational Methods in Science and Engineering
Publisher name: WSEAS Press
Place: Atény
Page from-to: 182-187
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Počítačová simulace fluorescenčních spekter pro molekulární prstenec: Dynamika excitonu Softwarový balík Mathematica je použit pro simulaci stacionárních fluorescenčních spekter pro molekulární prstenec. Pomocí takového systému může být modelována jednotka LH2 z bakteriálního systému purpurové bakterie Rhodopseudomonas acidophila. V simulacích je zahrnut dynamický nepořádek, interakce s fononovou lázní a tři různé typy nekorelovaného statického nepořádku: Gausovský nepořádek v lokálních excitačních energiích, Gausovský nepořádek v transferintegrálech a Gausovský nepořádek v radiálních pozicích molekul v prstenci. Pro výpočet spekter je použita Mukamelova metoda kumulantů. Poloha spektrálního maxima závisí na realizaci statického nepořádku a na dynamickém nepořádku. Diskutujeme různé typy dynamiky excitonu, které jsou svázány s výše zmíněnými jevy. LH2; fluorescenční spektrum; statický a dynamický nepořádek; excitonové stavy a dynamika; Mathematica
eng Computer simulation of fluorescence spectra for molecular ring: Exciton dynamics Software package Mathematica is used for computer simulation of steady state fluorescence spectra of ring molecular system. The cyclic antenna unit LH2 of the bacterial photosystem from purple bacterium Rhodopseudomonas acidophila can be modeled by such system. Dynamic disorder, interaction with a bath, is included in Markovian approximation. Also three different models of uncorrelated static disorder are taking into account in our simulations: Gaussian disorder in local excitation energies, Gaussian disorder in transfer integrals and Gaussian disorder in radial positions of molecules in the ring. The cumulantexpansion method of Mukamel et al. is used for the calculation of spectral responses of the system with exciton-phonon coupling. The peak positions of single ring spectra and localizations of exciton states depend on realization of static disorder. Dynamic disorder also influences the peak position. We discuss different types of exciton dynamics, that are coupled to above mentioned effects. LH2; fluorescence spectrum; static and dynamic disorder; exciton states and dynamics; Mathematica